Omnia Mykonos Boutique Hotel & Suites possède 16 chambres comprenant la climatisation, un minibar et un coffre-fort (suffisamment grand pour accueillir un ordinateur portable). Les chambres donnent sur un balcon ou patio. Chaque chambre bénéficie d'une décoration et d'un ameublement personnalisés. Les lits sont dotés de matelas Tempur-Pedic et sont préparés avec des draps en coton égyptien, une couette en duvet d'oie et de la literie de qualité supérieure. Une gamme d'oreillers au choix est à votre disposition. Une télévision à écran plasma est disponible dans les chambres. Les salles de bain comprennent une douche avec un pommeau de douche à « effet pluie », des peignoirs, des chaussons et des articles de toilette gratuits.
Vous pourrez accéder à Internet gratuitement par le biais d'une connexion sans fil. Des bureaux et un téléphone sont également disponibles. De plus, les chambres possèdent une machine à espresso et de l'eau minérale (offerte). Un service de préparation de lit en soirée est fourni, ainsi qu'un service de ménage tous les jours. D'autres prestations sont disponibles sur demande, notamment une literie hypoallergénique.